中藥質量研究國家重點實驗室（SKL-QRCM）致力於中藥質量評價的關鍵科學和技術問題，建設完整的中藥質量研發平台，凝聚建設多學科交叉的學術團隊，開展系統的轉化型研究，為中藥創新研發建立科學質量標準，發揮國際輻射交流作用。

模擬與混合信號超大規模集成電路國家重點實驗室（SKL-AMSV）主要開展各種電子系統的尖端研究，聚焦模數轉換器和低功耗射頻芯片兩個主要研究方向，同時積極發展電源管理和微流控芯片研究方向。

澳門大學為攻克腫瘤精準醫學這個世界難題，組建了兩大團隊，分別從生物醫學機理和生物醫學材料兩大方向進行攻關。其中澳大健康科學學院致力腫瘤精準醫學，建立澳門主要腫瘤冷凍組織庫及活細胞庫；研究癌生長、轉移、復發及耐藥機制；開發早期診斷癌症方法；鑒定癌症基因組驅動因素；篩選可殺死癌細胞的高效藥物；應用物理及材料工程研究院在碳基納米生物材料研究方面研製出具有獨特抗腫瘤效應的碳量子點材料。澳大精準醫學相關的藥理學與毒理學、臨床醫學兩個學科已經躋身世界頂尖基本科學指標（ESI）前1%。

澳門大學依託創建於2014年的應用物理及材料工程研究院，致力於納米結構材料的設計與合成，及其在環境治理、綠色能源、能源儲存、高效率光電-電光轉換等領域的開發與應用。在混合有源濾波器、鈣鈦礦太陽能電池及鋅空氣電池、超吸水膨脹及超導電高彈性凝膠材料等研究領域特色明顯，成績優異，主要研究成果包括混合有源濾波器、鈣鈦礦太陽能電池及鋅空氣電池、超吸水膨脹及超導電高彈性凝膠材料。鈣鈦礦LED電光轉化效率達12.9%的世界最高紀錄，超吸水膨脹凝膠吸水膨脹倍數高達至13,600倍，是世界紀錄的2倍多。

人工智能研究中心專注於計算智能算法、視覺和模式識別、數據的智能分析和預測、機器翻譯、人類語言技術、自然語言處理（NLP）、人機通訊、無人駕駛和智能機器人等研究，在澳門智慧城市現在和將來的發展方面都將發揮著至關重要作用。

數據科學研究中心致力培養新一代的數據科學家，進行各項跨領域的數據研究，推動深度知識探索並建立預測機制與模型，引導數據科學於人類生活的各層面應用，提昇新興科技產業發展，貢獻社會。

人文社科高等研究院致力推動人文社科的跨領域和跨學科研究，通過吸引校内外高水平人才入駐從事對澳門和國家具顯著意義的研究，構建高水準、跨學科、國際化、富有競爭力的綜合學術研究平台。

澳門研究中心致力於成為澳門和大中華地區的研究中心，聚焦澳門歷史、文化和社會。中心開展各種有助於知識和社會影響的學術和政策研究活動，通過參與創新和開拓性研究，旨在實現學術卓越，同時不忽視研究調查對澳門和大中華地區可持續發展的實際影響。